A HMDK testületei:

• a Közgyűlés,
• az Elnökség,
• az Ügyvezető Elnökség,
• az Ellenőrző Bizottság,
• a Panaszügyi és Etikai Bizottság.

Közgyűlés:
A közgyűlés a HMDK alapvető és legfelsőbb reprezentatív és döntéshozó szerve.
Rendes üléseit kétévente, tisztújító üléseit négyévente tartja.
A közgyűlés tagjainak mandátuma 4 évre szól.
A Közgyűlés tagjai az alapszervezetek és a jogi tagszervezetek által választott (és általuk visszahívható) küldöttei, valamint, tisztségük alapján, az Elnökség, az Ellenőrző Bizottság, valamint a Panaszügyi és Etikai Bizottság tagjai.

Elnökség:
A HMDK 30 tagú elnökségét  a közgyűlés választja meg 4 éves mandátumra.
Munkájáért a közgyűlésnek tartozik felelősséggel.

Ügyvezető elnökség:
A 10 tagú Ügyvezető Elnökséget az Elnökség választja meg tagjai sorából, négyéves mandátumra.
Az ügyvezető elnökség a HMDK operatív testülete, amely minimum három hetente ülésezik. Az üléseket az elnök vagy az ügyvezető elnök hívja össze.
Tagjai: a HMDK elnöke, ügyvezető elnöke, két alelnöke, titkára és további öt elnökségi tag.
Az ügyvezető elnökség ülése legalább hat tag részvételével tartható meg.
Határozatait egyszerű szótöbbséggel hozza meg.

Az ellenőrző bizottság:
Az ellenőrző bizottság háromtagú: elnök és két tag, akiket a közgyűlés választ meg vagy hív vissza.
Mandátumuk 4 évre szól.

Panaszügyi és Etikai Bizottság:
A Panaszügyi és Etikai Bizottság háromtagú: elnök és két tag, akiket a közgyűlés választ meg, illetve hív vissza.
Mandátumuk 4 évre szól.